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標題西南大學等解析斜紋夜蛾基因組齊一生物編

發(fā)布時間:2017/9/27  來源: 齊一生物科技(上海)有限公司   閱讀次數(shù):251        

 9 月 25 日,由西南大學家蠶基因組生物學國家重點實驗發(fā)起并主持,聯(lián)合法國、日本、印度、比利時和美國等多家研究機構(gòu)參與的鱗翅目害蟲斜紋夜蛾基因組相關(guān)研究成果于 Nature 子刊《自然—生態(tài)學與進化》上在線發(fā)表。該研究成果揭示了斜紋夜蛾的高質(zhì)量基因組精細圖譜,以及群體變異圖譜和基因表達圖譜。
 
斜紋夜蛾,又稱東方夜蛾,是一種廣食性和暴食性農(nóng)林害蟲,危害近 100 科的 300 余種植物,主要分布于亞洲和大洋洲的熱帶和亞熱帶地區(qū),具有高繁殖力和短周期等特征,近年來在我國長江流域和沿海地區(qū)爆發(fā)頻率明顯增加,給農(nóng)業(yè)尤其是蔬菜生產(chǎn)造成嚴重損失。
 
斜紋夜蛾基因組計劃由該校“外專千人計劃”特聘專家三田和英牽頭組織實施,研究歷時 5 年。研究人員首先構(gòu)建了一個 20 多個世代的斜紋夜蛾自交品系,采用單個體基因組樣本和全基因組鳥槍法方法,對斜紋夜蛾基因組進行測序和組裝,獲得 3597 條 Scaffold 序列(N50=915kb),采用簡化基因組測序策略,構(gòu)建高密度分子遺傳圖譜,組裝獲得 31 條染色體和大小約 438Mb 的斜紋夜蛾基因組精細圖譜。基因注釋獲得了 15317 個蛋白質(zhì)編碼基因,比較基因組分析揭示化學物質(zhì)感受、解毒及殺蟲劑抗性等相關(guān)基因相對于寡食性昆蟲的拷貝數(shù)顯著增加。印度、日本、中國熱帶和亞熱帶地區(qū)等地區(qū)的害蟲群體分析顯示廣泛的基因交流,表明斜紋夜蛾是長距離遷徙擴張和強適應性的農(nóng)業(yè)害蟲。

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