近日，倫敦慈善機(jī)構(gòu)英國癌癥研究宣布，由劍橋大學(xué)Greg Hannon率領(lǐng)的分子生物學(xué)家、天文學(xué)家和游戲設(shè)計(jì)者團(tuán)隊(duì)未來5年將會(huì)獲得2000萬英鎊的資助，用于研究
乳腺癌交互虛擬-現(xiàn)實(shí)圖。齊一生物編輯
這個(gè)項(xiàng)目僅是旨在建造新一代細(xì)胞圖集－－細(xì)致入微地描述器官和腫瘤的每個(gè)細(xì)胞的位點(diǎn)及構(gòu)成的圖集－－的其中一項(xiàng)。英國癌癥研究向另一個(gè)繪制類似
腫瘤圖的團(tuán)隊(duì)捐助了1600萬英鎊，該研究主要聚焦代謝和蛋白質(zhì)。
今年年底，美國國家精神健康研究所（NIMH）將宣布以非凡分子細(xì)節(jié)繪制小鼠大腦圖資助項(xiàng)目的獲得者。2月23至24日，研究人員將在加州斯坦福大學(xué)聚集，繼續(xù)討論《人類細(xì)胞圖集》，這是旨在繪制人體每個(gè)細(xì)胞的一項(xiàng)尚未得到資助的計(jì)劃。
"這是個(gè)非常熱的話題。"以色列魏茲曼科學(xué)研究所研究
基因組學(xué)免疫系統(tǒng)的Ido Amit說，"它全都是關(guān)于位點(diǎn)、位點(diǎn)、位點(diǎn)。科學(xué)界知道這一定是下一步。"
分子生物學(xué)家Hannon在第一次查看一個(gè)腫瘤時(shí)既吃驚了卻也受到了啟發(fā)。Hannon和同事利用一個(gè)虛擬-實(shí)境模型，里里外外地查看血管，收集了大量浸潤免疫細(xì)胞，并產(chǎn)生了一個(gè)創(chuàng)建史無前例的
腫瘤圖集的想法。"天助我也！"他回憶說，"這將會(huì)令人吃驚。"
Hannon最初看到的腫瘤是一個(gè)實(shí)物模型，真實(shí)模型將包括一個(gè)腫瘤的每個(gè)細(xì)胞中數(shù)千個(gè)基因和數(shù)十個(gè)蛋白的表達(dá)。他希望這樣的空間和細(xì)節(jié)功能能夠揭示更多關(guān)于影響一個(gè)
腫瘤對(duì)治療應(yīng)答的因素。
過去幾年，研究人員都熱衷于能夠讓他們測量完整核糖核酸補(bǔ)體（每個(gè)細(xì)胞中有成千上萬個(gè)）的技術(shù)。這些核糖核酸能夠揭示哪些基因被表達(dá)，并提供器官或
腫瘤內(nèi)一個(gè)細(xì)胞的獨(dú)特功能線索。
但測量方法通常需要將細(xì)胞從它們生存的組織中摘除下來。這將會(huì)破壞細(xì)胞在哪里、與哪些鄰居互動(dòng)的有價(jià)值的信息，這些信息可能含有一個(gè)細(xì)胞功能及其如何在疾病組織中扭曲的新線索。
"單細(xì)胞測序技術(shù)有很多令人興奮的地方，也很有前景。"瑞典斯德哥爾摩卡洛琳斯卡醫(yī)學(xué)院分子生物學(xué)家Nicola Crosetto說，"但當(dāng)我們想起癌癥和復(fù)雜生理組織時(shí)，我們需要將相關(guān)信息放入空間背景。"
相關(guān)技術(shù)已經(jīng)顯現(xiàn)。2月6日，魏茲曼研究所的Amit和Shalev Itzkovitz及其同事報(bào)告稱，他們已經(jīng)建立了一個(gè)由細(xì)胞構(gòu)成的小鼠肝小葉圖，這是通過每個(gè)細(xì)胞的核糖核酸序列完成的。小鼠肝小葉通常被分為同心層；該團(tuán)隊(duì)在位于兩個(gè)層面交界的細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了獨(dú)特的基因表達(dá)模式。"這個(gè)區(qū)域不僅是一個(gè)過渡區(qū)，還是一個(gè)擁有特殊功能的新區(qū)域。"
與此同時(shí)，Hannon也在與馬薩諸塞州哈佛大學(xué)生物物理學(xué)家 Xiaowei Zhuang合作，后者已經(jīng)研發(fā)出了用二進(jìn)制條形碼編碼RNA的一種方法，可利用成像技術(shù)在細(xì)胞內(nèi)讀取。該技術(shù)可在一個(gè)細(xì)胞內(nèi)同時(shí)測試數(shù)千個(gè)RNA，而無需讓其與周圍環(huán)境失去聯(lián)系。"每一次我看到這些有突出二維碼的圖像時(shí)，都讓我想起了電影《黑客帝國》。"Hannon說。
無論什么樣的方法使其走向頂端，研究人員都將需要開發(fā)展示數(shù)據(jù)的新渠道，Hannon說。"虛擬現(xiàn)實(shí)非常強(qiáng)大。"他說，"但信息量將會(huì)非常大，我們將會(huì)需要與信息打交道的新方法。
