中國(guó)科學(xué)院城市環(huán)境研究所水生態(tài)健康研究組楊軍團(tuán)隊(duì)利用 18S rDNA 高通量測(cè)序和 200 μm 孔徑濾網(wǎng)分級(jí)過(guò)濾方法比較研究了廈門兩個(gè)供水水庫(kù)真核浮游生物（> 0.2 μm）和微型真核浮游生物（0.2–200 μm）群落組成和多樣性。結(jié)果表明，真核浮游生物物種豐富度、多樣性以及 99.2%OTU 豐度經(jīng)過(guò) 200 μm 孔徑濾網(wǎng)過(guò)濾后無(wú)顯著變化，而且兩種粒級(jí)的生物群落均含有 25% 的后生動(dòng)物（節(jié)肢動(dòng)物為主）。深入比較分析發(fā)現(xiàn)，> 0.2 μm 和 0.2–200 μm 真核浮游生物群落表現(xiàn)出相似、同步的時(shí)空變化格局，而且能夠解釋兩種粒級(jí)生物群落變化的環(huán)境因子也完全一致。造成以上結(jié)果的主要原因是，采用 200 μm 分級(jí)過(guò)濾并不能有效去除大型真核浮游生物的幼體、殘?bào)w以及環(huán)境 DNA。此外，該研究還基于生物信息學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)方法揭示了序列測(cè)序深度和質(zhì)量控制對(duì)浮游生物群落分析的影響�？偟膩�(lái)看，以 200 μm 分級(jí)過(guò)濾為基礎(chǔ)的 DNA 高通量測(cè)序方法無(wú)法避免環(huán)境 DNA 污染，未來(lái)定量研究還需要結(jié)合 RNA 高通量測(cè)序和顯微等技術(shù)綜合分析。

該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金、福建省杰出青年科學(xué)基金、中科院城市環(huán)境所青年人才領(lǐng)域前沿項(xiàng)目資助。相關(guān)論文 DNA metabarcoding reveals that 200 µm size-fractionated filtering is unable to discriminate between planktonic microbial ａnd large eukaryotes 已于近日在線發(fā)表于國(guó)際期刊《分子生態(tài)資源》（Molecular Ecology Resources）。