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西南大學(xué)等解析斜紋夜蛾基因組齊一生物編
點(diǎn)擊次數(shù)：252 發(fā)布時(shí)間：2017/9/27
9 月 25 日，由西南大學(xué)家蠶基因組生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)發(fā)起并主持，聯(lián)合法國、日本、印度、比利時(shí)和美國等多家研究機(jī)構(gòu)參與的鱗翅目害蟲斜紋夜蛾基因組相關(guān)研究成果于 Nature 子刊《自然—生態(tài)學(xué)與進(jìn)化》上在線發(fā)表。該研究成果揭示了斜紋夜蛾的高質(zhì)量基因組精細(xì)圖譜，以及群體變異圖譜和基因表達(dá)圖譜。
斜紋夜蛾，又稱東方夜蛾，是一種廣食性和暴食性農(nóng)林害蟲，危害近 100 科的 300 余種植物，主要分布于亞洲和大洋洲的熱帶和亞熱帶地區(qū)，具有高繁殖力和短周期等特征，近年來在我國長江流域和沿海地區(qū)爆發(fā)頻率明顯增加，給農(nóng)業(yè)尤其是蔬菜生產(chǎn)造成嚴(yán)重?fù)p失。
斜紋夜蛾基因組計(jì)劃由該校“外專千人計(jì)劃”特聘專家三田和英牽頭組織實(shí)施，研究歷時(shí) 5 年。研究人員首先構(gòu)建了一個(gè) 20 多個(gè)世代的斜紋夜蛾自交品系，采用單個(gè)體基因組樣本和全基因組鳥槍法方法，對(duì)斜紋夜蛾基因組進(jìn)行測序和組裝，獲得 3597 條 Scaffold 序列（N50=915kb），采用簡化基因組測序策略，構(gòu)建高密度分子遺傳圖譜，組裝獲得 31 條染色體和大小約 438Mb 的斜紋夜蛾基因組精細(xì)圖譜�；蜃⑨尗@得了 15317 個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因，比較基因組分析揭示化學(xué)物質(zhì)感受、解毒及殺蟲劑抗性等相關(guān)基因相對(duì)于寡食性昆蟲的拷貝數(shù)顯著增加。印度、日本、中國熱帶和亞熱帶地區(qū)等地區(qū)的害蟲群體分析顯示廣泛的基因交流，表明斜紋夜蛾是長距離遷徙擴(kuò)張和強(qiáng)適應(yīng)性的農(nóng)業(yè)害蟲。
